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机构仓储（Institutional Repository），简称IR，又称为机构知识库、机构典藏库等。它的出现是由于研究机构原生数字资源的大量产出，期刊价格暴涨及商业出版的不合引起的全世界范围内的学术交流危机和研究人员对科研资源的迫切需求三者之间矛盾不断而产生的。
网络信息联盟的执行总监Clifford A. Lynch2003年对大学的机构仓储下了定义：一个大学的机构仓储是学校为师生员工提供的一套服务系统，用于管理和发布由其所产生的数字化资料。由于其已经不再从“资源”的角度来限定机构仓储，而是将机构仓储看成了一种服务，Clifford A. Lynch对机构仓储的看法被学术界广为接受。吴建中教授认为，机构仓储是指收集并保存单个或数个大学共同体知识资源的知识库。
机构仓储具有以下三个特点：一是综合性，机构仓储收录的资源具有综合性，弥补了部分学术数据库的缺陷，而且可以全面系统地反映所属学术机构的教学和科研。二是性，基于存取的机构仓储支持任何用户随时通过互联网不受地合理利用其中的知识资源，有利跨学科、跨地域的学术交流。三是动态性，机构仓储资源的提交者可以根据自己的最新研究随时修改、更新之前提交的信息。不过，这种动态性虽然可以加快学术交流的速度，但如果机构仓储内容更迭过于频繁，也有可能对其稳定性产生负面影响。
机构仓储功能有：（1）数字资源的提交和收集功能；（2）数字资源的描述功能；（3）基于工作流的资源审核与发布功能；（4）索引功能；（5）检索功能；（6）互操作功能；（7）管理功能；（8）存储和保存功能。
机构仓储保存、管理与利用的数字化内容包括：研究人员和教师已被学术期刊收录但未发表的论文预印本、已发表论文、技术报告、科研进展报告、硕博士论文、玉米地里的大嫂图书或其章节、科研数据库、会议记录、教学资料或课件、计算机软件、其他灰色文献等等。上述数字化内容可以文本、图像、音频、视频等不同格式在机构仓储系统中保存与利用。
目前，机构仓储解决方案主要可以分为3类：（1）专用系统，这类系统是机构仓储研究项目的，如eScholarship、JISC IE、Knowledge Bank等；（2）源码和免费的系统，如Dspace、Fedora、Archimede、CDSware等；（3）商业系统，如Documentum、Bepress、UMI / ProQuest 研制的DigitalCommons、DiMeMa公司研制的CONTENTdm、Innovative公司的DRM、BioMed中心的Open Repository等。