第三方物流管理信息系统（Management Information Systems，MIS）的系统设计是以计算机技术为支持，通过对物流配送的各环节进行有限的资源最优配置。一般说来，第三方物流管理信息系统功能包括两方面：一方面是物流管理信息系统中心，另一方面也是物流企业对外的Web站点。客户通过浏览器能与服务器进行通信，提供动态信息交互和信息服务，并在此基础上实现对订单下达、实时查询等业务的支持。因此，系统应把性、协调性、有效性作为系统开发的总体目标。
（1）系统性。由于供应链管理模式很强调整个供应链上物流提供和需求的有机统一，因此为满足第三方物流各部门及其外协物流伙伴的共同物流协作计划需要，系统必须具有一定的性。也就是说，第三方物流管理信息系统不应再是一个封闭式的孤岛系统，而必须是建立在互联网之上的式和集成化的供应链信息系统，通过信息的高度共享和交互与供应商、外协物流合作伙伴、顾客保持较好的沟通和联系。
（2）系统各节点的适用性。第三方物流管理信息系统应当适应企业单个业务分布和整体物流运作的要求。从企业运作角度来看，应当提供整体物流决策所需要的业务信息管理与分析以及物流决策的支持界面和全程反馈的管理界面；而对其外协物流合作伙伴则主要提供制订分配物流计划信息与作业进度信息反馈操作界面：对企业客户则提供具体的订单接收、运作安排计划信息和查询接口界面。
（3）平台的可扩充性。平台的可扩充性包括两个层面：一是空间上的可扩充性；二是时间上的可扩充性。空间上的可扩充性是指平台能够实现不同地理上的规模拓展，因为物流系统设施（如仓库）在空间上的变动很大，因此，物流信息平台必须适应物流设施的地域变化。时间上的可扩充性是指当用户需求、技术进步、企业组织结构随着时间的变化而变化时，系统能够对现有的某些功能模块进行或增加某些功能模块，以适应新的变化。
一般来说，物流管理信息系统的功能包含以下几个部分：（1）订单管理：使用通讯技术如邮件、传真和EDI或EOS登录和订单信息。（2）仓储管理：包括物品入库、物料在库移动、签收等环节。（3）运输管理：包括运输单证的形成、装车计划、制定线）包装管理：包括换装、分装、再包装等活动。（5）情报功能：包括与上述各项活动有关的计划、预测及有关费用情况。（6）财务管理：设计成本核算、运费计算等。
第三方物流管理信息系统除了传统的储存、运输、配送服务具有相应的功能外，应当还提供集成化的网络服务，如通过Internet与供应链上的客户进行数据交换，及时了解不同配送站点的库存数量、所有设备和人员的使用状况、供应链中供应商和协作商的信息，并能根据历史数据进行市场预测和决策等，这些功能都是现代化的物流配送系统的核心和出发点。
在系统地分析了供应链中第三方物流的实际作业流程后，我们可以得到第三方物流的管理信息流程，该流程是建立在全面了解、分析第三方物流企业实际作业流程基础之上的。现在我们分析一下管理信息系统的处理流程，如图2所示。
[page] （1）客户提交配送订单；（2）客户中心对客户进行身份认证，验证通过后进入下一步，客户中心也可及时反馈物流信息给客户，以方便客户查询；（3）订单模块存储订单信息，并进行分类整理；（4）根据订单要求向决策中心发送相关信息；（5）决策模块查阅库存信息、人员设备信息及其他运输、仓储外协合作商和供应商数据，并分析经营管理的历史数据，然后作出决策反应，并提交到配送中心；（6）配送中心向相应的配送站或者外协商和供应商进行配货、送货、退货返回等；（7）运输点执行配送任务；（8）财务管理模块通过网上或其他方式进行财务结算。
当然，在实际的作业过程中还涉及到其他的作业管理，如库存盘点、入库管理、人事管理、设备管理、客户管理、系统等等。
第三方物流管理信息系统功能结构可以划分为四个层次：数据管理层、业务处理层、决策管理层及战略管理层。
（1）客户管理子系统：客户登陆管理、客户资料管理、客户身份验证、客户查询、客户关系管理；（2）订单管理子系统：订单的接收、分类整理、查询；（3）仓库管理子系统：入库管理、出库管理、库存盘点、仓库优化管理、货物查询管理；（4）配送管理子系统：配货管理、送货管理、运输管理、运输调度管理、运输线决策、配送站点决策；（5）经营决策子系统：反馈信息管理、合作商管理、供应商管理、市场预测管理、市场信息管理、企业内部信息发布管理（包括企业介绍、经营、法律法规、市场报价等）；（6）账务管理子系统：成本预算管理、客户财务结算、供应商财务结算、合作商财务结算、财务统计管理、各子系统人力资源管理、人事考勤管理、设备维修管理；（7）系统管理子系统：用户管理、数据备份、系统设置、文档管理、查询打印服务等。
就我国目前对第三方物流管理信息系统的研究现状来看，存在着一些不足，主要体现在两个方面。一是把一般物流管理系统中都具备的内容归结为第三方物流管理信息系统的内容；二是系统规划和功能结构划分上还有欠缺。本文从第三方物流管理信息系统规划目标出发，结合第三方物流理论及其运作模式，从供应链角度对第三方物流业务流程和信息系统流程进行分析，在其管理信息系统的规划中考虑到了供应商、客户、外协物流合作伙伴之间的信息传递，突出了第三方物流的业务特点。
出于应对物流跨国化、提高物流竞争力的需要，第三方物流企业有必要从供应链管理的角度对其管理信息系统进行规划分析，应用信息技术和网络技术构建基于Web的物流管理信息系统，与供应链上下游节点各自的信息系统实现必要的衔接。在企业、外协物流合作伙伴和客户之间实现信息在整个供应链环节上的采集、传递和分析，从而实现对物流运作全过程的信息化管理。
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